Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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