Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf1B2RRD7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf1B2RRD7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms