Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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