Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf2A3KGV1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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