Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ckap5A2AGT5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms