Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myom3A2ABU4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms