Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Calcoco2A2A6M5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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