Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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