Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trip6Q9Z1Y4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms