Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ilf3Q9Z1X4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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