Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl27Q9Z1X0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms