Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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