Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ap3b2Q9JME5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms