Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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