Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms