Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nectin3Q9JLB9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms