Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms