Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms