Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ndufs3Q9DCT2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ndufs3Q9DCT2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ndufs3Q9DCT2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms