Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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