Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp12Q9D9M2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms