Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cnot8Q9D8X5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms