Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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