Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ifi35Q9D8C4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ifi35Q9D8C4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms