Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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MsraQ9D6Y7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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MsraQ9D6Y7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MsraQ9D6Y7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MsraQ9D6Y7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MsraQ9D6Y7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MsraQ9D6Y7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms