Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Ptp4a3Q9D658 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptp4a3Q9D658 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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