Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7Q9D541 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms