Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcc1Q9D4H2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcc1Q9D4H2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms