Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hddc3Q9D114 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hddc3Q9D114 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms