Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc47Q9D024 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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