Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms