Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms