Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms