Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rwdd1Q9CQK7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rwdd1Q9CQK7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms