Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms