Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms