Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc5Q99LG4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc5Q99LG4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc5Q99LG4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc5Q99LG4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms