Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms