Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rhbdd2Q8VEK2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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