Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms