Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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SbsnQ8CIT9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsnQ8CIT9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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