Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hpf1Q8CFE2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Hpf1Q8CFE2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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