Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms