Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Znf428Q8C1M2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Znf428Q8C1M2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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