Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccser1Q8C0C4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccser1Q8C0C4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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