Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4aQ8BW72 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms