Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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