Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8BGC1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q8BGC1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms