Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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