Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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